Analyse de données omics avec Simca
Objectifs
Les phénomènes biologiques sont multivariés par nature et les données générées par les technologies Omics sont généralement volumineuses et complexes. Dans ce contexte, les méthodes d’analyse multivariée sont particulièrement adaptées pour extraire l’information pertinente de ces grands ensembles de données. Cette formation présente la mise en œuvre des techniques d’analyse multivariée les plus récentes dans le cadre de l’analyse de données transcriptomiques, protéomiques et métabolomiques. L’élaboration et l’interprétation de modèles exploratoires (descriptifs) et discriminants (prédictifs) seront abordées, ainsi que la recherche de biomarqueurs et la validation des modèles.
Compétences acquises
Méthode pédagogique
Alternance d’exposés, de manipulations et d’exercices pratiques mis en oeuvre dans le logiciel Simca.
Programme
- Analyse de données Omics, potentiels et enjeux
- Introduction à l’analyse multivariée
- L’analyse en composantes principales (ACP)
- Application de l’ACP pour l’analyse exploratoire de données Omics
- Interprétation des modèles (tendances, détection d’aberrants)
- Exercices et discussion
- Introduction à l’analyse discriminante
- Analyse discriminante par régression PLS et OPLS
- Recherche de biomarqueurs dans les données Omiques (S-Plot)
- Comparaison de plusieurs traitements (SUS-Plot)
- Validation de modèles discriminants (validité et robustesse)
- Exercices et discussion
Public
Toute personne souhaitant découvrir les techniques d’analyse multivariée adaptées à l’analyse de données transcriptomiques, protéomiques et métabolomiques.
Pré-requis
Il est conseillé d’avoir participé au préalable au stage Méthodes PLS avec Simca ou d’avoir atteint par la pratique un niveau équivalent.
Suivi & Evaluation
Modalités d’évaluation Standard
- Questionnaire théorique en début de formation
- Questionnaire théorique en fin de formation
- Validation des acquis
- Attestation de formation
Modalités d’évaluation Certification
- Évaluation standard +
- Révision et préparation à l’examen (exercices pratiques...)
- Examen final en fin de formation via un jury permettant d'obtenir la certification du bloc de compétence
- Pour certaines formations, les compétences théoriques sont validées en amont du Jury via un QCM
- Certains examens internationaux impose un examen en ligne pour un durée allant de 2h à 4h
- Les dates d’examens peuvent évoluer en fonction des sessions
- En cas de non-admission ou de non-présentation du candidat, le candidat a la possibilité de se représenter à une session suivante en accord avec l’équipe pédagogique.
Dates
Accessibilité handicap
DYNACENTRIX s’engage auprès de ses clients et partenaires, sur la garantie de l'égalité des droits et des chances des personnes en situation de handicap pour accéder aux formations proposées et a mis en place un accueil spécifique qui travaille en étroite collaboration avec des organismes partenaires (AGEFIPH IDF, Cap emploi).
DYNACENTRIX accueille et accompagne les personnes en situation de handicap tout le long de leur parcours, en lien direct avec l’entourage professionnel et/ou familial des bénéficiaires, en adaptant sa pédagogie et le rythme de ses enseignements ».
CPF – Voir Appli Mon Compte Formation
Classe virtuelle Blended Learning
Inter-Intra entreprise
Sur mesure
Témoignages
Prochaine session
Durée : 2 jours (soit 14 heures)
Référence : -pls-02
Lieu : intra-entreprise
Prix : non communiqué
