Analyse de données omics avec Simca

Dernière mise à jour : 2 septembre 2022

Objectifs

Les phénomènes biologiques sont multivariés par nature et les données générées par les technologies Omics sont généralement volumineuses et complexes. Dans ce contexte, les méthodes d’analyse multivariée sont particulièrement adaptées pour extraire l’information pertinente de ces grands ensembles de données. Cette formation présente la mise en œuvre des techniques d’analyse multivariée les plus récentes dans le cadre de l’analyse de données transcriptomiques, protéomiques et métabolomiques. L’élaboration et l’interprétation de modèles exploratoires (descriptifs) et discriminants (prédictifs) seront abordées, ainsi que la recherche de biomarqueurs et la validation des modèles.

Compétences acquises

Méthode pédagogique

Une pédagogie active, l’apprenant étant au centre du dispositif
Des mises en situation ludiques et interactives
Les applications pratiques seront mises en œuvre
Du concret : toute la formation renvoie à la réalité professionnelle
De l’action : plus de 2/3 du temps est dédié à la pratique et à l’expérimentation
Du rythme : l’intérêt et l’attention du stagiaire sont stimulés par des explications en groupe ou individuelles, des échanges, des travaux et exercices personnels ou collectifs…
De l’individualisation : chacun apprend à son rythme pour renforcer son autonomie
De l’ancrage: les participants formalisent et synthétisent ce qu’ils apprennent pour une meilleure mémorisation des acquis
La formation réserve une place importante à l’interaction avec les participants.
Mise en situation par application concrète des outils sur vos données de travail durant la formation.

Programme

Analyse de données Omics, potentiels et enjeux
Introduction à l’analyse multivariée
L’analyse en composantes principales (ACP)
Application de l’ACP pour l’analyse exploratoire de données Omics
Interprétation des modèles (tendances, détection d’aberrants)
Exercices et discussion
Introduction à l’analyse discriminante
Analyse discriminante par régression PLS et OPLS
Recherche de biomarqueurs dans les données Omiques (S-Plot)
Comparaison de plusieurs traitements (SUS-Plot)
Validation de modèles discriminants (validité et robustesse)
Exercices et discussion

Public

Toute personne souhaitant découvrir les techniques d’analyse multivariée adaptées à l’analyse de données transcriptomiques, protéomiques et métabolomiques.

Pré-requis

Il est conseillé d’avoir participé au préalable au stage Méthodes PLS avec Simca ou d’avoir atteint par la pratique un niveau équivalent.

Suivi & Evaluation

Modalités d’évaluation Standard

Questionnaire théorique en début de formation
Questionnaire théorique en fin de formation
Validation des acquis
Attestation de formation

Modalités d’évaluation Certification

Évaluation standard +
Révision et préparation à l’examen (exercices pratiques...)
Examen final en fin de formation via un jury permettant d'obtenir la certification du bloc de compétence
Pour certaines formations, les compétences théoriques sont validées en amont du Jury via un QCM
Certains examens internationaux impose un examen en ligne pour un durée allant de 2h à 4h
Les dates d’examens peuvent évoluer en fonction des sessions
En cas de non-admission ou de non-présentation du candidat, le candidat a la possibilité de se représenter à une session suivante en accord avec l’équipe pédagogique.

Dates

Sur demande

Accessibilité handicap

DYNACENTRIX s’engage auprès de ses clients et partenaires, sur la garantie de l'égalité des droits et des chances des personnes en situation de handicap pour accéder aux formations proposées et a mis en place un accueil spécifique qui travaille en étroite collaboration avec des organismes partenaires (AGEFIPH IDF, Cap emploi).
DYNACENTRIX accueille et accompagne les personnes en situation de handicap tout le long de leur parcours, en lien direct avec l’entourage professionnel et/ou familial des bénéficiaires, en adaptant sa pédagogie et le rythme de ses enseignements ».

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